病原微生物檢測 | 納米磁珠助力mNGS
mNGS技術(shù)直接針對標本中核酸無偏倚檢測病原微生物序列，提取的核酸及構(gòu)建文庫的質(zhì)量是mNGS數(shù)據(jù)準確的關(guān)鍵要素。
01 兒童不明肝炎重癥率達到10%
2022年4月以來，世衛(wèi)組織（WHO）5個區(qū)域的33個國家向世衛(wèi)組織報告了650例病因不明的兒童急性肝炎疑似病例，其中至少38例兒童需要進行移植，已向世衛(wèi)組織報告了9例死亡（媒體公開信息報道）。不斷增長的不明原因兒童肝炎病例數(shù)，時刻牽動著大家的心。目前，病因尚無定論，但在致病原因調(diào)查中，腺病毒和新冠病毒被認為有很大嫌疑。
02 mNGS是不明病原微生物分析重要手段
2022年4月23日WHO發(fā)布了針對不明原因兒童急性嚴重肝炎的診斷建議，但并無具體診斷和治療方案意見。我國雖然尚無相關(guān)病例報告，國家重大公共衛(wèi)生事件醫(yī)學中心組織相關(guān)專家，根據(jù)已有的相關(guān)臨床和實驗室數(shù)據(jù)及新近國際兒童急性肝衰竭的處置流程或指南，編制了“不明原因兒童嚴重急性肝炎診斷和治療專家建議”。 經(jīng)普通臨床檢測仍無法明確診斷者，需要針對患者的血液、呼吸道分泌物、糞便、體液、肝穿組織等樣本進行病原宏基因組二代測序（metagenomicnext generation sequencing，mNGS）。
mNGS技術(shù)直接針對標本中核酸無偏倚檢測病原微生物序列，提取的核酸及構(gòu)建文庫的質(zhì)量是mNGS數(shù)據(jù)準確的關(guān)鍵要素。mNGS檢測流程基本包括標本采集、核酸提取、文庫制備、上機測序、數(shù)據(jù)庫比對、報告生成及結(jié)果解讀等一系列過程（圖1）。其中，核酸提取、PCR產(chǎn)物純化、片段篩選過程都可以使用納米磁珠實現(xiàn)高通量、快速和精準操作。
圖1.mNGS檢測流程圖
03 樣本處理是mNGS的關(guān)鍵步驟
mNGS檢測具有獨特的性質(zhì)：a)可檢測任意微生物，發(fā)現(xiàn)新的病原微生物; b）客觀檢測，不依賴假設(shè)；c)靈敏度極高，可定量檢測核酸; d）可檢測基因組的任一部分。因此，mNGS上機測序的核酸樣本非常關(guān)鍵，確保無外源核酸的污染。
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撰稿人：王艷芝 | 修訂：彭穎靜
